Новое оборудование для молекулярно-генетических исследований поступило в НМИЦ онкологии Минздрава России по нацпроекту

В лабораторию молекулярной онкологии Национального медицинского исследовательского центра онкологии (ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России) поступило новое оборудование для молекулярно-генетических исследований.

В рамках национального проекта «Наука и университеты» приобретён NGS-секвенатор, при помощи которого можно производить одновременное секвенирование (прочитывание) до 25 миллионов фрагментов ДНК. Один запуск прибора позволяет обрабатывать до 15 миллиардов нуклеотидов.

- При помощи нового прибора мы можем выполнять секвенирование de-novo и ресеквенирование малых геномов, метагеномные исследования, секвенирования целевых клинических панелей и клинических экзомов, а также определять профили экспрессии активных генов и целевых групп генов, - разъяснила заведующая лабораторией молекулярной онкологии НМИЦ онкологии Минздрава России, к.б.н. Наталья Тимошкина.

Учёные НМИЦ онкологии Минздрава России имеют опыт работы с NGS-секвенированием – это уже второй аппарат, работающий в учреждении. В 2019 году специалисты центра методом таргетного секвенирования первыми в России провели масштабное молекулярно-генетическое исследование нейроэндокринных опухолей поджелудочной железы. Информация о 27 идентифицированных и валидированных мутациях, значимых для нейроэндокринных опухолей поджелудочной железы, была размещена в международной базе данных COSMIC.

Методика NGS-секвенирования органично вписывается в научные направления, реализуемые на базе ростовского онкоцентра. Это омиксные исследования генетических и эпигенетических механизмов онкогенеза, результатом которых является идентификация новых предиктивных маркеров и мишеней терапии для различных типов злокачественных опухолей. А также идентификация полиморфизмов генов, ассоциированных с фармакологической эффективностью применяемых для терапии препаратов.

- Применение ещё одного секвенатора нового поколения расширит возможности поиска молекулярных маркеров для подбора лечения рака даже в сложных случаях. Наши специалисты смогут проводить тестирование пациентов для установления диагноза наследственных раковых синдромов. Частота некоторых из них достигает 10% из всех случаев. Это злокачественные новообразования желудочно-кишечного тракта, рак молочной железы, рак яичников, - отметил генеральный директор НМИЦ онкологии Минздрава России, д.м.н., профессор, академик РАН Олег Кит.

Благодаря новому секвенатору, в 2023 году в НМИЦ онкологии Минздрава России начнут выполнять молекулярно-генетическое тестирование методом высокопроизводительного секвенирования на наличие наследственных и соматических мутаций в ДНК, ассоциированных с риском развития рака молочной железы и рака яичников.